Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp13Q5BKP2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp13Q5BKP2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms