Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrig2Q52KR2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrig2Q52KR2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lrig2Q52KR2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms