Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccnl1Q52KE7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnl1Q52KE7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnl1Q52KE7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms