Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1qtnf9Q4ZJN1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C1qtnf9Q4ZJN1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms