Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddx49Q4FZF3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx49Q4FZF3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms