Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brinp3Q499E0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Brinp3Q499E0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brinp3Q499E0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms