Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mtmr11Q3V1L6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr11Q3V1L6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms