Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim9Q3V0X1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim9Q3V0X1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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