Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rimbp3Q3V0F0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rimbp3Q3V0F0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rimbp3Q3V0F0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms