Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc160Q3UYG1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc160Q3UYG1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms