Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms