Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chpf2Q3UU43 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms