Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim15Q3UTD9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim15Q3UTD9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms