Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm28047Q3US59 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm28047Q3US59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms