Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TceancQ3US16 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TceancQ3US16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms