Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Acsf3Q3URE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms