Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elf3Q3UPW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elf3Q3UPW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elf3Q3UPW2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms