Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms