Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep63Q3UPP8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep63Q3UPP8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms