Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cracr2aQ3UP38 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cracr2aQ3UP38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms