Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrc4Q3UP24 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrc4Q3UP24 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms