Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Washc4Q3UMB9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Washc4Q3UMB9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Washc4Q3UMB9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms