Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc33Q3ULW6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc33Q3ULW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc33Q3ULW6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms