Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pin1rt1Q3ULQ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pin1rt1Q3ULQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms