Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc61Q3UJV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc61Q3UJV1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc61Q3UJV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms