Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp19Q3UJD6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp19Q3UJD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Usp19Q3UJD6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp19Q3UJD6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms