Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm648Q3UJ22 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm648Q3UJ22 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm648Q3UJ22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm648Q3UJ22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Gm648Q3UJ22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm648Q3UJ22 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm648Q3UJ22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm648Q3UJ22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm648Q3UJ22 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms