Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed8Q3UHI4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed8Q3UHI4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed8Q3UHI4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed8Q3UHI4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms