Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3j1Q3UGC7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3j1Q3UGC7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms