Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Puf60Q3UEB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Puf60Q3UEB3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Puf60Q3UEB3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Puf60Q3UEB3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Puf60Q3UEB3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms