Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LbrQ3U9G9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
LbrQ3U9G9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms