Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf180Q3U827 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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Rnf180Q3U827 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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Rnf180Q3U827 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf180Q3U827 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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