Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Otud5Q3U2S4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otud5Q3U2S4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms