Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Vars2Q3U2A8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vars2Q3U2A8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Vars2Q3U2A8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms