Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Palb2Q3U0P1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Palb2Q3U0P1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms