Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem88bQ3TYP4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem88bQ3TYP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.7 ms