Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbxip1Q3TVI8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms