Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccndbp1Q3TVC7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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