Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3TTJ4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3TTJ4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3TTJ4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms