Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q3TQQ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q3TQQ9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Q3TQQ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms