Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nlrp4cQ3TKR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4cQ3TKR3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms