Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc13Q3TIR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc13Q3TIR1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms