Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Zfp444Q3TDV8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zfp444Q3TDV8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms