Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam178bQ24JP3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam178bQ24JP3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms