Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tdrd9Q14BI7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tdrd9Q14BI7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tdrd9Q14BI7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Tdrd9Q14BI7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms