Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp4r2Q0VGB7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp4r2Q0VGB7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms