Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b3Q0VF55 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b3Q0VF55 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms