Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rundc1Q0VDN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rundc1Q0VDN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rundc1Q0VDN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms