Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Itgb8Q0VBD0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Itgb8Q0VBD0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms