Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zc3h18Q0P678 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zc3h18Q0P678 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms